案情：被告人王明，国有宏源股份有限公司经理。1998年市检察院收到一封检举信，揭露该公司偷税100万元的事实。检察院经调查后，认为该公司确有偷税事实，依法应追究刑事责任，遂经检察长批准对该公司立案侦查。1998年7月2日检察院批准逮捕王明，并派检察院侦查人员将其逮捕。7月8日犯罪嫌疑人王明聘请的律师向检察院提出取保候审的申请，检察院提出需缴纳5万元保证金，并提供保证人。7月9日律师向检察院缴纳了5万元的保证金，并且提供了保证人，王明被取保候审。后经侦查发现，该公司自1996年到1998年间，共偷税漏税50万元，检察院冻结该公司帐户，并将50万元作为税款上缴国库。该案于1999年8月1日向区人民法院提起公诉，经法庭审理，认为该公司的行为已构成偷税罪，判处被告人王明有期徒刑3年，缓刑3年，对该公司判处200万元的罚金。检察院认为一审法院对被告人王明量刑过轻，直接向二审法院提交抗诉状，提起抗诉。抗诉期满后，对该公司判处的罚金一审法院即交付执行。二审法院经不开庭审理后，认为一审法院认定事实正确，但量刑过轻，裁定撤销原判，改处被告人王明有期徒刑7年。现问：
该案中人民检察院有哪些程序不合法.
被告人王明，国有宏源股份有限公司经理。1998年市检察院收到一封检举信，揭露该公司偷税100万元的事实。检察院经调查后，认为该公司确有偷税事实，依法应追究刑事责任，遂经检察长批准对该公司立案侦查。1998年7月2日检察院批准逮捕王明，并派检察院侦查人员将其逮捕。7月8日犯罪嫌疑人王明聘请的律师向检察院提出取保候审的申请，检察院提出需缴纳5万元保证金，并提供保证人。7月9日律师向检察院缴纳了5万元的保证金，并且提供了保证人，王明被取保候审。后经侦查发现，该公司自1996年到1998年间，共偷税漏税50万元，检察院冻结该公司帐户，并将50万元作为税款上缴国库。该案于1999年8月1日向区人民法院提起公诉，经法庭审理，认为该公司的行为已构成偷税罪，判处被告人王明有期徒刑3年，缓刑3年，对该公司判处200万元的罚金。 检察院认为一审法院对被告人王明量刑过轻，直接向二审法院提交抗诉状，提起抗诉。抗诉期满后，对该公司判处的罚金一审法院即交付执行。二审法院经不开庭审理后，认为一审法院认定事实正确，但量刑过轻，裁定撤销原判，改处被告人王明有期徒刑7年。
现问：
（三） 张××是某研究院办公室主任，一天，办公室收到来自下级研究所的一份文件，内容是该研究院所关于成立一个专家咨询委员会的打算。张××在该文件眉首写了 “请领导办公会议讨论决定”字样。一周后，该研究院领导经过研究，同意下级研究所的意见，让办公室给下级研究所一个答复。下级研究所收到答复后不久，又发 来一份文件，将专家咨询委员会的组成人员名单报告上来，张××根据领导的决定，再次给下级研究所答复表示同意。
张××在文件眉首写“请领导办公会议讨论决定”的行为是（）。
［二］王X是某机关党委办公室主任。一天，办公室收到来自下级机关XX局党委的一份文件，内容是XX局党委关于成立一个专家咨询委员会的打算。王X在该文件眉首写了“请领导办公会议讨论决定”字样。一周后，该机关领导经过研究，同意XX局党委的意见，让办公室给XX局党委一个答复。XX局党委收到答复后不久，又发来一份文件，将专家咨询委员会的组成人员名单报告上来。王X根据领导的决定，再次给XX局党委答复表示同意。
根据党的机关公文工作规程，回答下列问题：
我来回答:
